離子色譜儀雖然市場(chǎng)上種類繁多，但是其結(jié)構(gòu)主要包括泵液系統(tǒng)、進(jìn)樣系統(tǒng)、色譜分離柱、檢測(cè)器、數(shù)據(jù)處理五個(gè)部分組成。離子色譜儀工作原理是充分利用固定相與流動(dòng)相間的交換作用，固定相中離子交換樹(shù)脂上可離解的離子與流動(dòng)相中具有相同電荷的溶質(zhì)離子在分離色譜柱中滯留時(shí)間長(zhǎng)短不同，分析物溶質(zhì)與交換劑之間親和力的差異性進(jìn)行分離。
離子色譜儀測(cè)定常見(jiàn)陰離子效果比較好，比較適用于親水性陰、陽(yáng)離子的分離。色譜儀便于檢測(cè)的常見(jiàn)陰離子包括：F-,Cl-,Br-,NO2-,PO43-,NO3-,SO42-等;檢測(cè)的陽(yáng)離子主要包括:Li+,Na+,NH4+,K+,Ca2+,Mg2+,Cu2+,Zn2+,Fe2+,Fe3+等。
離子色譜儀具有快速、高效、準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn)，對(duì)于高濃度樣品的檢測(cè)，檢測(cè)結(jié)果不太理想，只有把高濃度樣品進(jìn)行稀釋，然后再進(jìn)行測(cè)定分析。而且離子色譜儀測(cè)定的范圍也比較有限，設(shè)備使用過(guò)程需要經(jīng)常維護(hù)，才能確保其性能良好。
離子色譜儀工作流程基本大同小異。其流程主要為：
(1)對(duì)淋洗液系統(tǒng)進(jìn)行必要檢查，打開(kāi)氬氣氣瓶開(kāi)關(guān)，調(diào)節(jié)減壓閥指示為0.2-0.3Mpa;打開(kāi)淋洗液系統(tǒng)氣源裝置，調(diào)節(jié)減壓閥，使指示表顯示為3-6PSi。
(2)分別按順序打開(kāi)主機(jī)-電腦-打印機(jī)等設(shè)備電源開(kāi)關(guān)，對(duì)設(shè)備進(jìn)行上電操作。
(3)系統(tǒng)處理及控制系統(tǒng)上電接通后，進(jìn)入操作界面，并進(jìn)入系統(tǒng)操作面板，準(zhǔn)備操作前的準(zhǔn)備及管理工作。
(4)打開(kāi)泵。如色譜分析儀長(zhǎng)時(shí)間不使用或更換淋洗液后，要先打開(kāi)平衡泵頭上的PRIME閥排氣后再開(kāi)泵，待泵壓力穩(wěn)定后再打開(kāi)抑制器電源。
(5)在進(jìn)入色譜柱之前通過(guò)進(jìn)樣器將樣品導(dǎo)入,流動(dòng)相將樣品帶入色譜柱,在色譜柱中各組分被分離,并依次隨流動(dòng)相流至檢測(cè)器。
(6)檢測(cè)器檢測(cè)到的信號(hào)送至數(shù)據(jù)系統(tǒng)，利用操作界面做完樣后，選擇檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)入數(shù)據(jù)處理，對(duì)采集數(shù)據(jù)進(jìn)行記錄、處理、打印或者保存等操作。
(7)關(guān)機(jī)，系統(tǒng)關(guān)機(jī)需要根據(jù)檢測(cè)樣品不同選擇不同關(guān)機(jī)步驟。對(duì)于陰陽(yáng)離子，需要先將抑制器電流關(guān)掉，然后再關(guān)泵，后關(guān)主機(jī)。